Shinji es el personaje principal de la serie, y en cierto punto es decepcionante.
Es cobarde, inseguro, frustrado, tiene muy baja autoestima y ademas lo que mas le interesa es mejorar su relacion con su padre, Gendou Rokubungi, lo cual no logra en la serie. Su madre, Yui Ikari murio en una prueba con el Eva 01, cuando este la absorbio.
Fue abandonado por su padre cuando era muy chico, lo cual repercutio mucho en su forma de ser.
A lo largo de la serie veremos como va madurando, hasta sorprendernos en algunos momentos.
Rei, es por mucho, el personaje mas interesante de la serie. De ella, se sabe muy poco, pero lo que se sabe es algo extraño.
Para empezar claro, rei es un clon de Yui Ikari, con mezclas del ADN de Lilith. Es por esto, que la Rei que sale en la primera parte de la serie, es la segunda, ya que la primera fue ahorcada por Naoko Akagi, madre de Ritsuko.
El tercer clon de Rei, es el mas indiferente y malevolo. Ella es una parte crucial para el inicio del Third impact, al juntarse con Lilith.
A lo largo de la serie, ira evolucionando, es decir, va perdiendo su timidez, y se relaciona mejor con todos.
El pasado de Asuka es de lo mas raro. En pocas palabras, su madre enloquecio y confundia a Asuka con una muñeca. Asuka le dedico tiemo a sus estudios, y despues fue escogida para ser piloto del Eva 02.
Cuando su mamá se entero de esto, se suicido colgandose de una cuerda.
A ella le gusta ser la mejor en todo, critica a los demas cuando puede, y es soberbia y engreida. Pero todo esto tiene un motivo, y este es que no quiere sentire sola.
Misato es un personaje que esconde lo que realmente sufrio en una etapa de su vida. Ella fue la unica sobreviviente de la mision Katsuragi, la cual ocasiono el Segundo Impacto cuando redujeron a Adam a su fase de embrion. Su padre sacrifico su vida para salvarla a ella, al meterla en una capsula de supervivencia.
Despues del incidente, decidio que seria una persona alegre, divertida y superficial, solo para olvidar su pasado, y tratar de vivir una vida normal.
Ritsuko es un personaje muy importante para el desarrollo de la serie. Tiene un pasado un poco tenso, pero no muy dramatico. Ella odiaba a su madre, pero la admiraba como cientifica.
Es muy introvertida, y es dificil de tratar, pero conforme avanza la serie, va perdiendo su dureza y seriedad inicial. Un punto interesante es que ama a Gendou con todo su corazon.
Al principio, Touji solo es uno de los compañeros de clase de Shinji, con el cual empieza mal, ya que en el combate del Eva 01 con Sachiel 8tercer Angel), su hermana salio herida.
Al avanzar la serie, este se convierte en el Fourth Children, piloto del Eva 03, el cual acaba siendo poseido por un Angel. Despues de que el Eva 01 acabo con el Angel, Touji perdio su pierna izquierda, y se retiro del trabajo de piloto.